Étiologies des Fièvres en Zone Rurale Guinéenne : Une Étude Transversale par PCR Révélant la Part Importante des Infections Bactériennes et des Coinfections: Etiologies of Fever in Rural Guinea: A Cross-Sectional PCR Study Revealing the Significant Share of Bacterial Infections and Co-Infections

Abstract

RÉSUMÉ
Introduction. Dans les zones rurales d'Afrique de l'Ouest fortement endémiques pour le paludisme, la fièvre est fréquemment attribuée à cette unique parasitose, conduisant à un traitement empirique et à la méconnaissance d'autres étiologies. À Maferinyah, en République de Guinée, cette pratique pourrait masquer une part importante d'infections bactériennes et de coinfections. Cette étude visait à décrire le spectre étiologique précis des fièvres dans cette région à l'aide de techniques moléculaires avancées. Méthodologie. Une étude transversale descriptive a été menée sur une période de 3 mois et 13 jours (du 15 mai au 28 août 2014) au Centre National de Formation et de Recherche en Santé Rurale « Jean Senecal » de Maferinyah et dans les postes de santé périphériques de Madinagbé et Fandié. Au total, 158 patients fébriles ont été inclus. Le diagnostic étiologique a été établi par amplification génique (PCR) pour la détection de Plasmodium spp. et d'agents pathogènes bactériens. Résultats. La PCR a identifié un pathogène dans 78% des échantillons (123/158). Plasmodium falciparum était l'agent pathogène prédominant, responsable de 63% (99/158) des épisodes fébriles. Les infections bactériennes pures représentaient 15,2% (24/158) des cas, impliquant principalement Staphylococcus aureus (5%) et des streptocoques (13%). Les coinfections paludisme-bactéries étaient fréquentes, représentant 16,3% (20/123) des cas positifs. Les rickettsioses ont été identifiées dans 3% des cas. Conclusion. Cette étude démontre que si le paludisme reste la cause principale de fièvre à Maferinyah, les infections bactériennes et les coinfections sont sous-estimées. Cette situation entraîne une utilisation inappropriée des antipaludiques et une sous-utilisation des antibiotiques lorsqu'ils sont nécessaires. Le renforcement des capacités diagnostiques et la mise en œuvre d'algorithmes cliniques incluant les causes bactériennes de fièvre sont indispensables pour optimiser la prise en charge des patients en zone rurale.
ABSTRACT
Introduction. In highly malaria-endemic rural areas of West Africa, fever is frequently attributed solely to malaria, leading to empirical treatment and overlooking other etiologies. In Maferinyah, Republic of Guinea, this practice may mask a significant burden of bacterial infections and co-infections. This study aimed to describe the precise etiological spectrum of fevers in this region using advanced molecular techniques. Methodology. A descriptive cross-sectional study was conducted over a period of 3 months and 13 days (from May 15 to August 28, 2014) at the "Jean Senecal" National Center for Training and Research in Rural Health in Maferinyah and in the peripheral health posts of Madinagbé and Fandié. A total of 158 febrile patients were included. Etiological diagnosis was established by PCR for the detection of Plasmodium spp. and bacterial pathogens. Results. PCR identified a pathogen in 78% of samples (123/158). Plasmodium falciparum was the predominant pathogen, responsible for 63% (99/158) of febrile episodes. Pure bacterial infections accounted for 15.2% (24/158) of cases, primarily involving Staphylococcus aureus (5%) and streptococci (13%). Malaria-bacteria co-infections were frequent, representing 16.3% (20/123) of positive cases. Rickettsial infections were identified in 3% of cases. Conclusion. This study demonstrates that while malaria remains the primary cause of fever in Maferinyah, bacterial infections and co-infections are underestimated. This leads to inappropriate use of antimalarials and underuse of antibiotics when needed. Strengthening diagnostic capabilities and implementing clinical algorithms that include bacterial causes of fever are essential to optimize patient management in rural areas.