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RÉSUMÉ
Contexte. La diarrhée demeure un problème de santé publique au Mali. Le but de ce travail était d’identifier les facteurs de pathogénicité et les gènes de résistance aux antibiotiques des souches d’Escherichia coli isolées chez les enfants diarrhéiques de moins de 5 ans. Matériels et Méthodes. L’étude a concerné les enfants âgés de 0 à 59 mois diarrhéiques reçus dans 4 centres de santé communautaires de Bamako. Une coproculture standard a été effectuée, suivie d’une recherche de gènes par PCR. Les gènes codant les adhésines (bfp, eae, ipah et eagg), les entérotoxines (slt1, slt2, lt et sta), la résistance aux bêta-lactamines (oxaA1, shv, tem), aux phénicolés (catA1), aux cyclines (Tet), aux quinolones (qnrA, qnrB, qnrS) et les intégrons de classe 1 (intl1), classe 2 (intl2) et classe 3 (intl3) ont été recherchés. Résultats. 120 patients des quatre centres communautaires ont été inclus ; le sexe masculin a été le plus représenté avec 62%, de même que la tranche d’âge de 7 à 12 mois. E. coli a été isolé dans 30,8% des cas. Les gènes de virulence les retrouvés étaient : slt1 (11), sta (16), bfp (7), eae (7) et ipaH (6). Les intégrons et gènes spécifiques de résistance aux antibiotiques les plus retrouvés étaient : int1 (14 cas), int3 (13), tet (25), shv (8), tem (15), et qnrS (11). Conclusion. Escherichia coli demeure fréquente chez les enfants diarrhéiques avec une production de toxine et une résistance aux antibiotiques usuels nécessitant une surveillance moléculaire renforcée.
ABSTRACT
Background. Diarrhea remains a public health problem in Mali. The aim of this work was to identify pathogenicity factors and antibiotic resistance genes of strains of Escherichia coli isolated in cases of diarrhea in children under 5 years. Material and method. The study involved children aged 0 to 59 months seen in 4 community health facilities. A standard coproculture was carried out followed by a conventionnal PCR. The genes encoding the adhesins (bfp, eae, ipah and eagg), the enterotoxins (slt1, slt2, lt and sta), the resistance to beta-lactams (oxaA1, shv, tem), to phenicols (catA1), to cyclins (Tet), to quinolones (qnrA, qnrB, qnrS), Class 1 (intl1), class 2 (intl2) and class 3 (intl3) integrons were searched. Results. 120 patients from 4 community health facilities were included; the male sex was the most represented with 62%, as well as the age group from 7 to 12 months. E. coli was isolated in 37 patients (30.8%). The most virulence genes found were: slt1 (11), sta (16), bfp (7), eae (7), ipaH (6). The most integrons and antibiotic resistance genes found were: int1 (14 cases), int3 (13), tet (25), shv (8), tem (15), qnrS (11). Conclusion. Escherichia coli remains common in children with diarrhea associated with toxin production and resistance to common antibiotics, requiring enhanced molecular surveillance.

Keywords

Children Diarrhea Bamako E. coli Resistance genes. Enfants Diarrhée Bamako E. coli Gènes de résistance

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This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

How to Cite
Ibrehima Guindo, Alhadji Alassane Dicko, Issa Konaté, Karamoko Sacko, Mahamadou Abdou, Sounkalo Dao, & Flabou Bougoudogo. (2022). Facteurs de Pathogénicité et Résistance aux Antibiotiques des Souches d’Escherichia coli isolées chez les Enfants Diarrhéiques de 0 à 59 Mois en Milieu Communautaire à Bamako: Facteurs de Pathogénicité et Résistance aux Antibiotiques des Souches d’Escherichia coli isolées chez les Enfants Diarrhéiques de 0 à 59 Mois en Milieu Communautaire à Bamako. HEALTH SCIENCES AND DISEASE, 23(5). https://doi.org/10.5281/hsd.v23i5.3615
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References

  1. Diawara F, Coulibaly D, Diarra S, Simaga T. Facteurs favorisants les maladies diarrhéiques chez les enfants de 0 à 5 ans en commune II du district de Bamako au Mali. Mali Santé Publique. 2018;8(1):25-30.
  2. Organization WH. International Decade for Action Water for Life, 2005-2015. Wkly Epidemiol Rec. 2005;80(22):195-200.
  3. Carré D. Conduite à tenir devant une diarrhée aiguë. Étiologies. EMC-chirurgie. 2004;1(5):493-532.
  4. Le Bouguénec C. Diagnostic des différents pathovars de Escherichia coli responsables de diarrhées chez l'homme. Rev Fr Lab. 1999;314:33-7.
  5. Mariani-Kurkdjian P, Bonacorsi S, Bingen E. Diagnostic bactériologique des infections Gastro-Intestinales. Bactériologie Médicale. 2016:149-161.
  6. Sara A, Yousra M. Mise en point des méthodes de détection d’Escherichia coli productrice de Shiga-toxine [Memoire de Master]: Universite Mohamed El Bachir El Ibrahimi; 2021.
  7. Riley LW, Remis RS, Helgerson SD, McGee HB, Wells JG, Davis BR, et al. Hemorrhagic colitis associated with a rare Escherichia coli serotype. N Engl J Med. 1983;308(12):681-5.
  8. Brugère H, Auvray F, Mariani-Kurkdjian P, King LA, Loukiadis E, de Maisons-Alfort F. E. coli producteurs de shigatoxines (STEC): définitions, virulence et propriétés des souches entérohémorragiques (EHEC). Feuill Biol. 2013;54(311):79-86.
  9. Shaikh S, Fatima J, Shakil S, Rizvi SMD, Kamal MA. Antibiotic resistance and extended spectrum beta-lactamases: Types, epidemiology and treatment. Saudi J Biol Sci. 2015;22(1):90-101.
  10. Doumbia AK, Coulibaly O, Dembélé A, Diall H, Togo P, Cissé ME, et al. Déshydratation Aiguë chez les Enfants de 1 à 35 Mois Atteints de Diarrhée Aiguë au CHU Gabriel Touré. Health Sci. Dis. 2020;21(11) 83-87.
  11. EDSM V. Cellule de planification et de statistique (CPS/SSDSPF). Institut national de la statistique (INSTAT/MPATP), INFO-STAT et ICF international Enquete démographique et de santé au Mali (EDSM V). Edition de 2012;2013.
  12. Rocha MCGSd, Carminate DLG, Tibiriçá SHC, Carvalho IPd, Silva MLdR, Chebli JMF. Acute diarrhea in hospitalized children of the municipality of Juiz de Fora, MG, Brazil: prevalence and risk factors associated with disease severity. Arq Gastroenterol. 2012;49:259-65.
  13. Liu L, Johnson HL, Cousens S, Perin J, Scott S, Lawn JE, et al. Global, regional, and national causes of child mortality: an updated systematic analysis for 2010 with time trends since 2000. The lancet. 2012;379(9832):2151-61.
  14. Pishtiwan AH, Khadija KM. Prevalence of blaTEM, blaSHV, and blaCTX-M Genes among ESBL-Producing Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli Isolated from Thalassemia Patients in Erbil, Iraq. Mediterr J Hematol Infect Dis. 2019;11(1):e2019041-e.
  15. Pogue JM, Dudley MN, Eranki A, Kaye KS. 146 - Tetracyclines and Chloramphenicol. In: Cohen J, Powderly WG, Opal SM, editors. Infectious Diseases (Fourth Edition): Elsevier; 2017. p. 1256-60.
  16. Sapunaric FM, Levy SB. Substitutions in the interdomain loop of the Tn10 TetA efflux transporter alter tetracycline resistance and substrate specificity. Microbiology. 2005;151(7):2315-22.
  17. Grossman TH. Tetracycline antibiotics and resistance. Cold Spring Harb Perspect Med. 2016;6(4):a025387.
  18. Jacoby GA. Mechanisms of resistance to quinolones. Clin Infect Dis. 2005;41(Suppl2):S120-S6.
  19. Haffaf Amel FZ. Gastro-entérite aigue du nourrisson [These de Medecine]: Université Abou Bekr Belkaid -Tlemcen 2014.
  20. Shamki JA, Al-Charrakh AH, Al-Khafaji JK. Detection of ESBLs in Enteropathogenic E. coli (EPEC) isolates associated with infantile diarrhea in Kut City. Med J Babylon. 2012;9(2):403-12.
  21. Sire J-M, Nabeth P, Perrier-Gros-Claude J-D, Bahsoun I, Siby T, Macondo EA, et al. Antimicrobial resistance in outpatient Escherichia coli urinary isolates in Dakar, Senegal. J Infect Dev Ctries. 2007;1(03):263-8.
  22. Bourjilat F, Dersi N, Bouchrif B, Amarouch H, Timinouni M. Profil de résistance aux antibiotiques des Escherichia coli uropathogènes communautaires au Maroc. Eur J Sci Res. 2009;38(1):57-62.
  23. Saye T. Prévalence des entérobactéries productrices de beta-lactamases à spectre élargi au CHU du Point G de 2006 à 2008. [These de Médecine] : Université de Bamako. 2012.
  24. KOÏTA MS. Aspects moléculaires de la résistance aux antibiotiques des souches de Escherichia coli uropathogènes communautaires à Bamako [[Memoire]: Université Cheikh Anta Diop de Dakar. 2013.
  25. Dromigny JA, Nabeth P, Juergens-Behr A, Perrier-Gros-Claude JD. Risk factors for antibiotic-resistant Escherichia coli isolated from community-acquired urinary tract infections in Dakar, Senegal. J Antimicrob Chemother. 2005;56(1):236-9.
  26. Coulibaly Y, Konate A, Kone D, Bougoudogo F. Étude de la prescription des antibiotiques en milieu hospitalier malien. Rev Mali Infect Microbiol. 2014;3:2-8.
  27. Traore D, Daou F, Coulibaly D, Sy D. Analyse de la prescription des antibiotiques au CHU du point G. Rev Int Sc Méd Abj - RISM. 2021;23(2):123-27.
  28. Guessennd N, Bremont S, Gbonon V, Kacou-Ndouba A, Ekaza E, Lambert T, et al. Qnr-type quinolone resistance in extended-spectrum beta-lactamase producing enterobacteria in Abidjan, Ivory Coast. Pathol biol. 2008;56(7-8):439-46.
  29. Meradi L, Djahoudi A, Abdi A, Bouchakour M, Claude J-DPG, Timinouni M. Résistance aux quinolones de types qnr, aac (6′)-Ib-cr chez les entérobactéries isolées à Annaba en Algérie. Pathol Biol. 2011;59(4):e73-e8.
  30. Ploy M-C, Gassama A, Chainier D, Denis F. Les intégrons en tant que support génétique de résistance aux antibiotiques. Immuno-analyse & Biologie spécialisée. 2005;20(6):343-52.
  31. Ahoyo A, Baba-Moussa L, Anago A, Avogbe P, Missihoun T, Loko F, et al. Incidence of infections dues to Escherichia coli strains producing extended spectrum betalactamase, in the Zou/Collines Hospital Centre (CHDZ/C) in Benin. Med Mal Infect. 2007;37(11):746-52.
  32. Hammoudi A, Mouats A, Halbouche M. Sérotypes, antibiorésistance et identification de gènes de virulence des Escherichia coli pathogènes dans les élevages avicoles en Algérie. Actes des 1ères JE-RGAL, Mostaganem. 2009: :40-47.
  33. Yao RK, Coulibaly JK, Tiekoura BK, Yapi FH, Djaman JA. Molecular Characterisation of Extended-Spectrum Beta-lactamase Producing Escherichia coli Isolated from Cattle Faeces in Abidjan District, Ivory Coast. Microbiol Res J Int. 2018;25(5):1-10.

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