Les éditeurs de HSD recherchent des informations auprès des experts pour élargir vos connaissances scientifiques sur le COVID-19, suivre sa propagation et sa virulence, et donner des avis sur les mesures à prendre pour protéger la santé et empêcher la propagation de cette flambée, mais aussi pour prendre en charge les patients. Voici le minimum à retenir.

• Le COVID-19 (dénomination OMS) ou SARS-CoV-2 (dénomination du Coronavirus Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses) est un virus de la famille des Coronaviridae à l’origine de l’épidémie de COVID-19. Il partage 80% d’identité génétique avec le SRAS-CoV (2003) et 96% d’identité avec un virus de chauve-souris (Rhinolophus affinis).
• Le virion se fixe sur le recepteur ACE2 (abondant au niveau des cellules alévolaires et myocardiques).
• La transmission est essentiellement interhumaine. Sa contagiosité (nombre d’individus infectés par un cas) est de 2-3 alors que sa létalité est de 1-2%. Chez les cas diagnostiqués, elle est  plus basse (0,3-0,5%) en population générale mais peut monter à 7-9 % dans des sous groupes à risque. Le 26 mars 2020, soit au bout de trois mois d’évolution environ, il y a  environ 500 000 cas déclarés dans le monde et près de 22 500 décès.
• La période d’incubation est de 5 jours en moyenne (variation : 2-14 jours).
• Les signes typiques sont  infectieux (fièvre, asthénie) et respiratoires (toux plus ou moins productive, dyspnée), plus rarement cardiaques, digestifs ou ORL. La maladie peut être asymptomatique.
• Une lymphopénie est fréquente (80%) ainsi qu'une élévation des LDH.
• Le diagnostic est porté sur la RT-PCR (RNA-dependent RNA polymerase et gènes E). La PCR peut être négative si le prélèvement est mal fait (matériel acellulaire) et dans les premiers jours de la maladie. Les liquides où le test est le plus souvent positif sont le lavage bronchoalvéolaire (95%), les expectorations (70%), l’écouvillonnage laryngé et les selles (30%).
• La sensibilité de la radiographie pulmonaire est faible (60%). Celle du scanner thoracique est de 95%. Il permet donc de redresser le diagnostic chez 30% des patients à PCR négatif. En contrepartie, sa spécificité est faible (25%). Les signes radiologiques sont maximaux à J10 et associent  verre dépoli (lésion principale), épaississement des septa inter et intralobulaires (au sein de la lésion), condensation alvéolaire, bandes d'atelectasie et ligne sous pleurale. La  localisation est en règle bilatérale, basale et périphérique. La présence d'adénopathies, d'épanchement pleural ou de miliaire est plutôt rare et doit faire évoquer d'autres diagnostics en priorité. Des précautions particulières sont nécessaires au moment de l'acquisition des images.
• Sur le plan évolutif, la guérison est la règle (80 %) et la surinfection bactérienne est peu courante. La détresse respiratoire apparait en général au 7é jour (prévalence 2-3%). Des complications cardiaques sont présentes dans 20% des cas (troubles du rythme, insuffisance, choc).
• Les populations à risque sont les suivantes : sujets âgés, AVC, diabète, HTA, BPCO.  Les enfants paraissent être à faible risque.
• En dehors du traitement symptomatique (paracétamol, oxygène, etc.), les principaux protocoles associent azythromycine +  hydroxychloroquine / chloroquine (=antipaludéens/immunomodulateurs), Remdesinir (analogue des nucléotides), Lopinavir/ritonavir (=Inhibiteurs des protéases (AMM VIH)), et le tocizilumab (Anti-IL6 (PR, artérite à cellules géantes)).
• En matière de santé publique, les stratégies qui ont fait leurs preuves associent un dépistage aggressif (suivi de prise en charge en environnement protégé), une prise en charge multidisciplinaire parfois lourde et un confinement de masse, rigoureux et sans faiblesse.
• Plusieurs vaccins sont en train d’être développés, pour la plupart dirigés contre la protéine virale S.
• Cette pandémie, du fait de son impact majeur sanitaire, social, économique et politique est le sujet d'intenses débats géostratégicopolitiques. Elle pourrait reconfigurer les grands équilibres mondiaux.
• Les conséquences pour l'Afrique pourraient être terrifiantes si des mesures volontaristes associées à des moyens conséquents ne sont pas prises à temps.